Для начала необходимо определиться, какой разъём присутствует на кулере. Для этого можно ознакомиться с одним из ответов по ссылке.
Разъёмы 2-4 pin
Разъёмы 2-4 pin подключаются к соответствующей колодке на материнской плате. Колодки описаны в документации на материнской плате или на самой плате с разъёмом присутствуют надписи по типу: CPU_FAN, CHA_FAN1 и подобные, их можно определить и визуально, они всегда имеют пластиковую планку, которая вставляется в "ключ" на разъёме вентилятора. Разъём на процессорном кулере следует подключать к CPU_FAN.
Molex разъёмы
Molex разъёмы подключаются непосредственно к блоку питания. Разъём имеет специальную форму, чтобы не было возможности соединить его неправильно, поэтому если разъём не вставляется либо вы пытаетесь поставить его силой или же контакты немного не входят в посадочные места. Такое бывает, сами контакты в разъеме molex имеют некоторый свободный ход.